2012年，在全国第三轮一级学科评估中，“食品科学与工程”在参评的51家单位中排名第5，进入前10%。ESI（基本科学指标）2015年7月数据显示，学院对学校“农业科学”进入全球前1‰、“生物与生物化学”进入全球前1%作出重要贡献。2017年，在全国第四轮一级学科评估中，“食品科学与工程” 在参评的79家单位中排名第4，获评A类。

肉品加工与质量控制研究方向

· 学术带头人：周光宏教授、徐幸莲教授

现有专任教师22人，其中教授6人、副教授4人。主要从事肉品品质变化机制、肉品加工与质量安全控制技术、肉品营养等领域研究。拥有国家和部省级科研创新平台8个，形成了基础研究、技术研发、成品开发、技术集成推广、社会检测服务为一体的平台体系。近五年来，团队成员先后承担国家和部省级科研项目30余项，在国内学术期刊上发表论文近500篇，其中SCI论文200余篇，获得专利50余项，制定国内外标准20余项，获得国家科技进步奖二等奖1项（2013年）、部省级及行业组织奖励10余项，鉴定成果8项，研究水平处于国内领先、国际先进水平。

食品微生物与生物技术研究方向

· 学术带头人：陆兆新教授、董明盛教授

现有专职教师14人，其中教授4人、副教授6人。主要从事食品微生物源发酵产物、发酵技术及调控，益生菌发酵产品研制，新型食品酶挖掘与应用以及食源性致病菌快速检测等领域的研究。近五年来，团队成员先后承担/完成国家863计划项目、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、江苏省自然科学基金、江苏省科技支撑计划等各级课题50余项，近5年发表SCI论文100余篇，授权专利30余项。获得教育部科技进步奖3项，农业部科技进步奖1项，中国食品工业协会科学技术奖1项，中华农业科技奖1项，研究水平处于国内领先，国际先进水平。

农产品贮藏与加工研究方向

· 学术带头人:屠康教授、顾振新教授

现有专职教师14人，其中教授7人、副教授4人。主要从事果蔬采后生理、贮藏保鲜、农产品质量安全控制、果蔬、粮食加工等领域的研究和应用。依托农业部农产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（南京），在果蔬贮藏保鲜机理、无损检测技术、稻米深加工、功能成分富集、以及安全与风险评估等方面形成了研究特色。近五年来，团队成员先后承担国家和部省级科研项目30余项，在国内学术期刊上发表论文近500篇，其中SCI论文250余篇，获得国家发明专利50余项，软件著作权20余项，获得部省级以及行业组织奖励近10项，研究水平处于国内先进水平。

糖组学与糖生物学研究方向

· 学术带头人：曾晓雄教授

现有专职教师9人，其中教授3人，副教授3人，主要从事寡糖组学及生物工程、食品源多糖结构与功能及其构效关系、糖生物化学技术三个方面的研究。研究内容包括：糖链分子结构分析技术的创新研究（Anal Chem；Biosci Reports）、多种具有重要作用的新糖酶的挖掘与研究(ApplMicrobiolBiotechnol; ProtPeptLett)、食品中功能糖类物质的结构和生物学功能研究（Carbohydr Polym; JFunct Foods）、基于糖分子的食品生物纳米技术研究（Chem Communi; J Phys Chem B; J Agric Food Chem; Food Hydrocolloid）、糖分子的酶法改造（Green Chem; Chem Eng J）等，获得授权发明专利10多项，实用新型专利3项，团队研究内容和技术手段达到了国际先进水平。

食品营养与人体健康研究方向

· 学术带头人：辛志宏教授

现有教授1人，副教授5人，研究生30余人。主要研究食品中各种组分的化学结构、理化性质、营养功能、安全性以及各组分与人体健康之间的关系等，分析影响食品安全的各种因素并制定相应的预防控制措施，探索各组分在食品生产、加工和储藏期间的变化规律及其对营养功能的影响。近5年承担国家食用菌产业技术体系、国家科技支撑计划、国家自然科学基金和部省级等多项课题的研究工作，发表论文150余篇，其中SCI收录70余篇，获省、部级科学技术进步一、二等奖4项。